どうしても404ページでNOT FOUNDを流したかったので、近所のサーバサイドエンジニアに頼み込んで設定方法を教えてもらいました。
/etc/nginx/conf.d/ 以下に hogehoge.conf という設定ファイルをつくり、
server { ... error_page 404 /404.html; ... }
という感じでエラーページを指定すればOKです。
僕の環境の場合、404.htmlを用意した場所がrootの外だったので、
server { ... error_page 404 /../404.html; ... }
という感じで指定する必要がありました。
無事に404ページでNOT FOUNDが流せるようになったので良かったです。感謝。